Филиппинский военный корабль, который с 1999 года нелегально стоит на мели на рифе Жэньай, нанес серьезный ущерб разнообразию, стабильности и устойчивости экосистемы коралловых рифов в этом районе.
Научное исследование экосистемы коралловых рифов в районе рифа Жэньай и прилегающей к нему акватории, которое было проведено в апреле этого года сотрудниками Экологического центра Южно-Китайского моря и НИИ развития ЮКМ при Министерстве природных ресурсов КНР, показало, что длительное нахождение корабля на грунте в районе рифа Жэньай нанесло смертельный ущерб экосистеме коралловых рифов, а также значительно замедлило рост и восстановление кораллов в окрестностях.
Осаждение тяжелых металлов, вызванное коррозией корпуса корабля, в сочетании со сбросом бытовых отходов и сточных вод персоналом на борту нанесло длительный вред здоровью кораллов.
Экосистема коралловых рифов также серьезно подорвана отходами рыболовства, выбрасываемыми с борта корабля и филиппинских рыболовецких судов, что подтверждено исследованиями при помощи спутникового дистанционного зондирования.
В официальных документах подчеркнуто, что Китай обладает неоспоримым суверенитетом над островами Наньша и прилегающими к ним водами, включая риф Жэньай.
В 1999 году филиппинский военный корабль незаконно сел на мель у рифа Жэньай. Китайское правительство незамедлительно выразило протест и потребовало немедленного вывода судна. Филиппинская сторона неоднократно обещала вывести судно, однако это обещание остается невыполненным.
Медиакорпорация Китая представила документальный фильм об исследовании экологической ситуации в районе рифа под названием «Ren'ai Jiao: Teardrop of the Nansha Qundao» («Риф Жэньай: слеза островов Наньша»), где рассказывается о печальной судьбе экосистемы акватории.